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首個國家基因庫深圳啟航 擬打造中國版“諾亞方舟”

中國首個國家基因庫——深圳國家基因庫9月22日開始正式運營。這個依托深圳華大基因研究院組建的國家級基因庫,目前已存儲多種生物資源樣本超過1000萬份。

中國的國家基因庫位於深圳市大鵬新區觀音山腳下,一期占地面積4.75萬平方米,里面建有基因測序房、超級計算房以及冷凍資源房。而它的規模更體現在它的內容上。它由三個庫和兩個平臺組成:三個庫分別是用來存儲和管理中國特有遺傳資源的生物資源樣本庫,目前已存儲多種生物資源樣本1000萬份;生物信息數據庫,目前它可檢索條目數已經超過一個億;生物活體庫,中國希望把它打造成為中國的諾亞方舟,保護和保存世界約三十萬種植物、百萬種動物、近千萬種微生物活體資源。兩個平臺是數字化平臺和合成與編輯平臺,主要是用來處理數據。這個基因庫現在號稱是全球最大的綜合性基因庫。

深圳國家基因庫就是要把全球的生物資源都收集起來,用測序儀讀取萬物的遺傳數據,用超級計算機算出結果,用合成與編輯平臺寫出生命代碼,最後再用來為人類服務。中國的這艘“諾亞方舟”,和其他國家的基因庫一樣,承載著人類及其他生物的遺傳樣本和密碼。中國也需要這樣一個平臺,從國家層面對具有中國特色的生物樣本和基因數據進行有效保存、管理和合理利用。

在這之前,美國、歐洲、日本都已經建立了大型基因數據庫,這三大庫里的生物信息數據幾乎涵蓋所有已知的脫氧核糖核酸、核糖核酸和蛋白質數據。中國國家基因庫與這三大庫的不同就在於,它不僅僅是數據庫,而是國際上現有的各類生物樣本庫、數據庫、生物多樣性庫、疾病庫等的綜合升級版。除了基因、蛋白、分子、影像等多組學生物信息數據庫,也就是所謂的“幹庫”和多樣性生物樣本和物種遺傳資源庫,也就是所謂的“濕庫”之外,中國的國家基因庫還引入了“活庫”,也就是生物活體庫,將存儲的內容擴展到動物資源、植物資源、微生物資源和海洋資源。同時,該基因庫不僅面向科研,還面向推動中國精準醫學、精準農業的發展,把對基因的利用用於推動產業發展。

深圳國家基因庫也是一個開放的平臺。目前,中國國家基因庫已與聯合國糧食及農業組織、國際農業研究磋商小組、國際生物及環境樣本庫協會、挪威斯瓦爾巴全球種子庫、美國自然歷史博物館等100多個組織和科研機構建立戰略合作關系,在人類健康、生物多樣性、生物進化機制等方面開展合作研究。

據介紹,目前深圳國家基因庫已建成20PB數據的可訪問能力。以一部電影約500MB計算,20PB相當於4000萬部電影,一個人一天看一部電影,至少需要10萬年才能看完。

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