「長江上游漁業資源嚴重衰退，金沙江主流的魚類自然資源狀況亦瀕臨崩潰，」這一結論來自農業部長江流域漁業資源管理委員會（簡稱「長漁會」）與世界自然基金會8月聯合發佈的長江上游考察報告。
該考察隊由32人組成，包括雙方工作人員、中國科學院水生生物研究所、復旦大學生命科學院等相關專業的學者。考察6月9日從玉樹開始，歷時12天。沿途經過通天河、金沙江上游、金沙江中下游及赤水河流域，考察河流水質、水電站建設對河流生態的影響，及沿岸地貌與自然環境。
今年長江禁漁期已經結束，漁業秋汛開始，但洞庭湖漁民捕撈情況卻十分糟糕，有漁民反映不及往年十分之一。這還是發生在今年長江「水量大、高水期水量強、並且對非法捕撈執法最好」的背景下。此現象使得世界自然基金會淡水部的雷剛十分擔憂。
據「長漁會」辦公室主任趙依民統計，整個長江流域漁民的捕撈量豐腴年份是每年10萬噸，今年這樣的正常年份則只有7、8萬噸。這與1950年代40萬到50萬噸左右的自然捕撈量相差甚遠。魚苗的產量也從3000多億尾降到現在的1億多尾。在品種上，整個長江上游魚類應有140多種，特有魚類70多種，而是次聯合考察的多次採樣除了三個外來魚種，僅捕到14種魚。
長江流域漁業資源管理委員會在整個長江已發放的「捕撈證」約7萬份，考慮漁民家庭作業的習慣及鄱陽湖等地的無證捕撈，「長漁會」辦公室主任趙依民估計整個長江流域漁民數量在20萬左右。長江漁業產量已無法滿足相應捕撈需求。他認為，單就長江上游而言，水電工程是影響漁業的最主要因素。
長江特有魚類多集中在上游地區，而這恰是長江水能資源集中流域。2013年國務院國函（2012）220號批復了水利部主持的《長江流域綜合規劃（2012-2030年）》。按此規劃，到計劃期末，金沙江上中下游25個大型水電項目總裝機容量達到7660萬千瓦。而三峽電站在去年32台70萬千瓦發電機組和兩台電源機組全部投產後，裝機容量達到2250萬千瓦。金沙江25級電站合計發電量超過3個三峽。其中，金沙江中、下游兩段共計12座電站正在開發中，其中7座已建成、1座在建、2座籌建中。而金沙江上游的13級水電位於青藏高原腹地，目前
狀態均為「規劃中」。
長江魚類在繁殖和覓食中洄游行為都十分普遍。水電站的建設除了阻斷魚類洄游通道，還會影響水溫。水電站排放尾水多為水庫底層低溫水，層層疊加，可能導致江水水溫降低。溫度和水流強度無法達到要求，魚類繁殖受阻。
是次考察的第六天，考察隊在金沙江中游的石鼓進行魚類資源採樣調查。作為「長江第一灣」，石鼓歷史上可以捕到大部份上游水生樣品，但是次採樣儘管請專業漁民進行「漁網密度和捕撈強度都相當大」的捕撈，整個上午僅捕到五尾魚，部份不足巴掌大。
除了三峽、葛洲壩等大中型水電，長江支流上的小水電項目也相當密集。任職於世界自然基金會上海辦事處的任文偉介紹，許多上游地區位於深山之中，地形不便，拉電網存在困難，建設小水電有助於解決當地用電問題。儘管單個小水電的產能並不很大，但對於社區生產的確可以帶來幫助，不但能拉動經濟，還可以改善居民生活水準。
但由於同樣原因，部份小水電位置偏僻、規模不大，修建之前缺乏相對完整的環境評估報告。本次科考中，科考隊見過小水電為發電，將水通過管道引入導流渠，導致河流乾枯，對魚類造成毀滅性打擊。另一些項目儘管具有環評報告，但往往只針對小流域生態和地方的一兩個物種進行。梯級水電疊加對整個流域生態的影響缺乏評估。這一現象在長江幹流上的大、中型水電中也存在。
西方發達國家在過去50年裡大力發展水電專案，目前水電利用率已達到70％、80％，河流大壩的生態影響也逐漸得到關注。除了為現有大壩增加特別設計的游魚通過系統，美國華盛頓州還正在艾爾華流域對壽命到期的大壩展開拆除行動。中國水電相對滯後，目前正處於高速建設和發展期。世界自然基金會的雷剛表示，與火電、煤電相比，水電的環境影響相對較小，屬於清潔能源，但過度開發也會對生態產生很大影響。
但根據已有規劃，長江上游水電建設非但不會停止，力度還將繼續增加。趙依民認為，長江上游水電建設給魚類帶來的生態影響不可逆轉，如果規劃中的水電全部建設起來，那麼長江上游的魚類自然資源將徹底枯竭。
【總之】長江漁業捕撈量繼續遞減，與此同時，對漁業影響巨大的水電站建設正處於高速發展中，不能因為水電是清潔能源就完全忽視它的副作用。