日前，深圳市藥監部門對外披露，近幾年來，受政策環境及市場惡性競爭等因素影響，深圳市連鎖藥店佔藥店總量比例由2003年的85%，降至2009年 60%，2011年進一步下降至51%。有業內人士對記者透露，深圳的情況比較特殊，其他省市連鎖藥店的經營情況相對較好，但整體來說，由於得不到有效的 政策扶持與近年來成本上漲過快等因素影響，全國連鎖藥店的經營情況均不太理想。
深圳「藥店多過米店」
一位不願具名的國內連鎖藥店集團的總經理對南都記者表示，與其他省市相比，深圳對連鎖藥店和單體藥店的准入條件相當之低，並且都是一樣的，藥店的經營場地 只需要大於60平方米即可。而連鎖藥店比起單體藥店，其前期投入和運營成本相對較高，這對前者來講相當不利。而且之前深圳對於藥店的密度，也沒有專門的限 制措施，導致有些地方，「藥店多過米店」，所以深圳市場看似體量巨大，然而競爭卻十分激烈，並且深圳的單店租金和人力成本，甚至比上海和北京等大城市都要 高，所以單店利潤甚至還低於某些二三線城市。
藥店過多造成惡性競爭
某醫藥行業資深研究人士則認為，現在中國的連鎖藥店集團，每個的規模都太小，難以形成規模效應，從而難以進行有效的大規模擴展因而較難形成規模競爭優勢， 處於擴張期的藥店由於管理經營能力較差，因而也較難盈利。以美國為例，美國最大的連鎖藥店w algreen在2011年門店數量達到8210家，總銷售722億美元(其中處方藥的銷售收入佔總收入的65%)，淨利潤27億美元。從這個數字也可以 看出，連鎖藥店行業的利潤率並不高，必須達到比較大的規模，才有可能獲得可觀的盈利。而就我國的企業來看，門店數目達到1000家的都為數不多。
但是從藥店總量卻嚴重超過人們的需求。依據美國的經驗，大概每5000-6000人一家藥店會比較合理，以我國目前的城市人口占總人口數50%計算，藥店 數目在10萬家左右比較合理，但目前的實際數量遠遠超過這個數目，這就導致大家都陷入了「紅海」之中，惡性競爭下，誰也佔不到便宜。而值得注意的是，單體 藥店由於銷售靈活，藥價可以做得比連鎖藥店低，而且成本也能夠比連鎖藥店的要少，因此其盈利能力高於後者。
另外，在有些重點區域，比如大城市的人員較為聚集的地方，藥店的密度更加之大，從而導致競爭相當的慘烈，尤其是像深圳的鬧市區，據瞭解，連鎖藥店基本都是不盈利，「賠本掙吆喝」。
政策無實際利好
在政策上，雖然國家「十二五」規劃裡面明確，到「十二五」末實現連鎖佔三分之二的比例，然而落實到實際，連鎖藥店卻未拿到什麼真正的利好。
前述連鎖藥店總經理對記者透露，以比較重要的基本藥物的銷售為例，國家的醫改政策對社區醫院實行零差價政策，同時進行補貼，這就使得社區醫院對基本藥物平 進平出，藥店根本無法與之競爭。在稅收等方面也沒有對連鎖藥店有實際上的優惠，而很多單體藥店卻可以利用某些漏洞進行逃稅，這使得經營上壓力很大。
據悉，近日深圳市藥品零售企業合理佈局政策正式出台。該政策規定，將以社區為單位，常住人口數量與現有藥店數量之比小於2700：1的社區，不再新建藥店。但受訪的業內人士均表示這種政策象徵意義大於實際意義。
前述醫藥行業研究人士對記者表示，在目前的這種情況下，連鎖藥店只有通過提高自身的運營能力來提高單店盈利能力，在激烈的競爭下，有些藥店倒閉，有些藥店 進行整合，直到最終只剩下有限的幾家連鎖藥店以及把藥店總數降低到10萬家以下，才有可能談盈利，但這需要一個比較長的時間，在此之前，連鎖藥店行業可能 都是目前這種慘淡經營的現狀。而這種現狀，並不符合國家鼓勵連鎖藥店做大做強的目標。